肿瘤的遗传多样性与疾病侵袭性或治疗抗性有何关系?
回答这样的问题,需要分析大量不同类型的样本。全基因组或全外显子组测序需要用到特殊仪器和复杂的数据分析,成本也相对较高。MGH研究团队开发的新方法要简单得多,该方法只针对人类基因组的一个小区域——poly-G重复片段。这一区域对细胞分裂时出现的突变特别敏感。尽管这些突变与肿瘤发育没有直接关联,但它们可以揭示肿瘤的谱系,解析不同肿瘤细胞之间的关系。
肿瘤能够通过转移扩散到机体的其他部分,但人们对这一过程并不十分了解。此前,研究者们一直难以确定转移发生在原发瘤发育的什么阶段,或者特定转移瘤是否直接来自于原发瘤。现在,科学家们开发了一个简单的新方法,能够快速分析患者体内多个肿瘤位点之间的进化关系,为制定合适的治疗方案提供宝贵信息。
“构建患者体内所有肿瘤的‘家谱’,不仅可以帮助我们确定肿瘤之间的差异,还有助于了解肿瘤的发展史,”文章的通讯作者,麻省总医院MGH的Kamila Naxerova博士说。“通常这需要进行大量的遗传分析和复杂的测序研究。不过我们的新方法,能够简单快速的达到这一目的。”这项研究发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志的网站上。
直到最近,癌症研究者们才开始分析肿瘤之间的遗传差异,例如不同肿瘤位点之间的差异,以及原发瘤和转移瘤的差异。据介绍,目前的肿瘤转移模型主要有两种:一种认为原发瘤在发育晚期发生转移,在这种情况下原发瘤细胞和转移瘤细胞的遗传差异应该很小;另一种模型认为转移发生在肿瘤发育的早期,那么在演化之后,原发瘤和转移瘤细胞的遗传差异应该很显著。此前有研究指出,这两种模式适用于不同类型的癌症,不过这样的结论还缺乏足够的患者数据。
研究团队使用的Poly-G重复片段分析法,原本是为了在小鼠中研究不同细胞之间的谱系关系,现在他们将其应用于人类癌症研究。研究人员对22名大肠癌患者的原发瘤和转移瘤样本进行了poly-G分析,他们发现原发瘤和转移瘤之间的关系可以说因人而异。
在某些患者中,肿瘤位点之间存在显著的遗传差异,说明转移发生在原发瘤发育的早期。而另一些患者中,原发瘤和转移瘤的差异很小。研究人员还发现,某些来自同一个原发瘤的转移瘤,会因为所处位置的不同而产生遗传差异。此外,某些转移瘤的遗传特征只类似于原发瘤中的某些细胞,这意味着这些细胞才是转移瘤的来源。
“我们发现,肿瘤转移有不少路径,”Naxerova说。“目前,我们正在对更大量的样本进行poly-G分析,希望解决更多与肿瘤转移有关的临床问题。poly-G分析速度快而且成本低,可以广泛用于大肠癌以外的其他肿瘤类型。”
文章的共同作者Elena Brachtel介绍道,研究中使用的是归档保存的组织。“对手术切除的组织进行诊断之后,福尔马林固定的石蜡包埋组织还可以保存数年,以便日后人们通过更先进的技术进行分析。”
文章的资深作者Rakesh K. Jain补充道,“poly-G分析有多种潜在的临床应用。例如,可以快速鉴定转移瘤的来源。”明确原发瘤和转移瘤的关系,将为人们提供重要的临床信息。生物通 www.ebiotrade.com
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